低聚果糖也稱為FOS，是在某些植物的根中發現的略帶甜味的碳水化合物。它具有與菊粉相似的某些有益特性，在這兩種天然益生元中，FOS較甜，分子鏈較短。它被歸類為纖維是因為它通過消化道而沒有被代謝直到到達結腸。與纖維素纖維（麩等）不同，它是可溶性纖維，在許多蔬菜中都可以找到它。它的味道很好，甜度約為糖的一半。
低聚果糖是植物糖的鏈。它們取自蘆筍，洋姜和大豆，或在實驗室中生產。人們用這些糖做藥，低聚果糖常被口用于便秘，有些人將它們用于減肥，預防旅行者的腹瀉，治療高膽固醇和骨質疏松癥。但是，用于支持這些其他用途的科學研究有限。低聚果糖也被用作益生元。不要混淆益生菌和益生元，它們是活的生物，例如乳酸桿菌，雙歧桿菌和釀酒酵母，對您的健康有益。益生元可作為這些益生菌的食物。人們有時會通過口攝入益生菌和益生菌，以增加腸道中的益生菌數量。