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生物藥開發是一個非常復雜的過程，而構建適用于工業生產的高表達的穩定細胞株是生物藥工藝開發的起點和基礎，后續開發、臨床前和臨床工作都是基于某一確定的細胞株進行開展。
與此同時，細胞株產量會影響到生產的成本，質量會影響到藥物的安全性和有效性。因此，細胞的單克隆篩選在確保生物制藥產品的純度和均一性上至關重要。
進行單克隆篩選是為了減少細胞庫的異質性，減少單克隆細胞篩選的復雜流程，保持生產過程的一致性和可預見性，確保產品的產量和質量在預設的范圍內。
常見的單克隆獲取方法：
目前常見的單克隆獲取方法主要包括以下三個：有限稀釋法、高通量細胞系篩選儀和流式細胞熒光分選技術。
一、有限稀釋法：
有限稀釋法是傳統的挑選單克隆的方法，該方法操作簡單，對儀器設備的需求比較低，并且方便與成像系統關聯使用。因此，是目前應用比較多的單克隆挑選方法。
一般要求鋪板密度在0.5cell/well或以下，操作簡單但是耗時較長。另一個缺點是效率比較低，需要在大量的96孔板或者384孔板中進行挑選才有可能獲得理想的克隆（一般需要在不低于1000個克隆中挑選）。
二、高通量細胞系篩選儀：
高通量的單克隆篩選設備，是在半固體培養基中使用機器進行篩選。相對于有限稀釋法，單克隆篩選設備使用半固體培養基，應用熒光顯色的方法挑選高表達克隆，因此具有人工干預少、通量大、效率高的優點。
但是這種設備也有不足。有限稀釋法的單克隆培養基與后期工藝培養基更為接近，克隆在孔板的表現更接近在生產過程中的表現。此外，高通量細胞單克隆篩選設備價格較為昂貴，難以在普通企業中采用該方法。
三、流式細胞熒光分選技術（FACS）：
FACS法的原理是根據細胞大小、熒光染料和細胞表面marker等因素挑選出所需要的單細胞，當前廣泛應用于單細胞分離，稀有細胞分選等多項研究中。一般而言，該法可用于鑒定、分離具有高水平膜蛋白表達的細胞。
使用FACS法，單克隆形成率很高，并且FACS法可以和單克隆成像系統連用，確定單克隆。但在沒有成像系統輔助的情況下，一般認為單純的一輪篩選是不夠的，可以通過有限稀釋法挑選亞克隆來增加單克隆率。
缺點是在整個篩選過程中，細胞的形態及狀態會對條件和分離效果產生影響，流式細胞儀在分選過程中也可能會對細胞狀態有一定影響。
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