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催芽是保證種子在吸足水分后，促使種子中的養分迅速分解運轉，供給幼胚生長的重要措施。不同的種子使用的催芽技術存在一定的差別，例如樹木的種子主要是通過低溫處理，而馬鈴薯等塊莖類則是可以使用低溫、二氯乙醇、氯吡脲、膨果龍和赤霉素等處理，而光照培養箱為瓜菜種子提供保溫催芽。
既解決了早春低溫下播種難發芽的技術問題，又提高了育苗的質量。而在使用種子發芽箱進行催芽的過程中需要注意以下幾個注意要點。
使用種子發芽箱進行催芽的五大注意事項如下
1.變溫處理。種子進箱時溫度采用20～25℃，第二天25～30℃，第三天28～32℃，第4～5天又降至25～28℃。
2.搶冷尾暖頭播種。種子發芽箱雖然能提早催芽播種，但不能育苗太早，應在2月下旬適時催芽，搶暖頭播種。
3.分批選芽。不同作物的種子，其發芽勢都不一樣，發芽勢強的比發芽勢弱的前后相隔2～3天，如果前期不分別揀芽(胚根)，待后邊種子出芽(胚根)時，前頭的芽根已過長、無法播種。所以，對這類芽勢強弱不同的品種要分別揀芽、分批播種。
4.芽(根)長短要適度。應當注意，只有芽(根)長短適中，育苗效果才好。一般芽(根)長以0.5～1厘米為宜，這樣不但出苗快而早，抗寒力也強，而且成苗率高，生長速度快。但長芽(根)播種費工，易損傷芽(根)尖，所以播種工作要細致，塑料營養缽育苗要用手指打穴洞播種。剛破殼的種子雖然播種簡便，只要在營養缽上插入即可，但出苗期要遲3～4天，如果遇上長期低溫陰雨連綿天，則要遲4～7天。
5.合理利用箱室。種子箱室內不宜放太多的種子，特別是用塑料裹著的種子。如存放過多，膠袋離加熱管太近或緊挨著，當電熱絲在管內啟動加熱時，塑料袋受熱后易烤焦起火，不但會燒壞種子，連設備也容易燒壞，甚至引起火災，得不償失。
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