靶向質譜同位素分析(即選定的反應監測或SRM)是用于驗證臨床相關生物標志物的基于抗體的檢測的替代方法,但也被用于基于發現的定量蛋白質組學。這種策略的一個障礙是每一種肽都具有特性的生化特性,其氨基酸組成和可能的翻譯后修飾決定了其從液相色譜柱、電離和碎片化的洗脫特性。為了開發診斷性臨床質譜測定,必須在對體內分析有效的肽之前用合成肽表征這些肽的性質。還可通過將已知量的重肽添加到生物樣品中,利用重穩定同位素合成肽用于絕對定量。這些策略也常用于驗證大規模定量蛋白質組學分析的結果。
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