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車載氣相色譜儀由六大系統組成：氣路系統、進樣系統、分離系統、控溫系統、檢測和記錄系統。整個載氣系統要求載氣純凈、密閉性好、流速穩定及流速測量準確；進樣就是把氣體或液體樣品勻速而定量地加到色譜柱上端；分離系統的核心是色譜柱，它的作用是將多組分樣品分離為單個組分；用于控制和測量色譜柱、檢測器、氣化室溫度，是氣相色譜儀的重要組成部分；檢測系統檢測器的作用是把被色譜柱分離的樣品組根據其特性和含量轉化成電信號，經放大后，由記錄儀記錄成色譜圖。
車載氣相色譜儀要由固定相和流動相組成：固定相和流動相各自有不同的吸附和分配作用;通過兩相的相對運動，被檢測物質隨流動相一起運動，這樣物質就在兩相間進行反復的分配，從而把不同的組織分離開來。
使用和操作流程一般包括以下幾個程序：
1.加熱
不同廠家生產的氣相色譜儀給定溫度的方式是不相同的。溫度給定方式一般可分為：微機設數法、旋鈕定位法等。如果采用微機設數法給定溫度，溫度可以直接被設置。如果是采用旋鈕定位法，其使用則有技巧。采用過溫定位法，將溫控旋鈕調至低于操作溫度約30℃處，給氣相色譜儀升溫。
2.調池平衡
調池平衡也就是所謂的調熱導電橋平衡，其目的是使儀器的輸出較為合適。對于具有池平衡、調零功能和記錄功能的儀器，需要講究一定的調節技巧。
3.點火
對于氫焰氣相色譜儀，開機的時候需要點火。或者因為某些原因，火熄滅后也需要重新點火。然而，點不著火的情況我們會經常遇到，所以點火也是需要一定技巧的。通用的點火方法是，先加大氫氣的流量，然后再進行點火，之后將儀器緩慢調回到工作狀態。
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