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在實際使用過程中，pH傳感器可能存在以下問題：靈敏度/斜率下降、響應緩慢、噪聲信號和化學損傷。
1、靈敏度/斜率：pH值與探針電極電位之間存在一定的理論關系。新的pH探針可以接近其理論斜率（即，25℃下每pH單位的電極電勢為59mv），但其靈敏度將隨著探針的老化或破壞而繼續下降。在將系統校準到一定的pH值（由緩沖液設置控制）后，使用一種或多種緩沖液進行檢查。與預期結果相反，pH計的讀數將系統地偏離已知緩沖溶液的pH值。如果獲得的線路陡峭，則坡度設置得太低；如果生成的線相對平坦，則表示坡度設置得太高。
2、清潔：當pH探針顯示延遲響應或靈敏度降低時，需要清潔。pH探針惡化的主要原因是發酵液中的物質污染了多孔塞。如果多孔塞被污染，它將從白色變為棕色或黑色。為了防止污染，可將pH探針浸入10mmol/LHCl溶液中，以免損壞pH傳感器（這也可用于在間歇操作期間定期存儲pH探針）。有時加入胃蛋白酶有助于清除蛋白質沉積物。如果HCl處理沒有效果，可以嘗試以下兩種方法。盡管它們有一定的損壞pH探針的風險，但也有一定的影響。將pH探針浸入約1%H2O2溶液中約1-2小時；或對多孔塞進行輕度機械清潔，即使用鋒利的刀片刮除外表面的沉積物。
3、電干擾：pH計和放大器電路的高阻抗可能會導致一些問題，這使得pH探頭對其他電氣設備雜散場入口感應電壓引起的噪聲以及包含pH探頭信號的兩個端子之間的少量電流泄漏引起的誤差響應更為敏感。為此，pH傳感器或pH計的制造商提供特殊的屏蔽線和端子。如果噪聲過大，可以將pH探針線從其他導線上拆下以降低噪聲。攪拌器電機可能是干擾源，可通過關閉電機幾秒鐘來檢查。
4、防止機械損壞：pH探頭非常脆弱，在安裝和清潔發酵罐期間很容易損壞。因此，建議在發酵罐制備的后期插入pH探針（此處需要校準），使用后首先取出pH探針。許多傳感器損壞的情況是由于在不取出傳感器的情況下直接提起發酵罐的頂蓋而造成的。為了避免在間歇操作期間在存儲期間損壞探頭，一種簡單的方法是將傳感器放置在塑料量筒中，量筒中裝有特殊溶液。選擇合適的量筒尺寸，以便探頭的較寬部分也可以放入。球形檢測部分懸掛在底部上方。同時，最好用夾具固定量筒。
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