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酶標分析儀本質為一臺變相光電比色計或分光光度計，基本工作原理與主要結構和光電比色計基本相同。光源燈發出的光波經過濾光片或單色器變成一束單色光，進入塑料微孔板中的待測標本。
該單色光一部分被標本吸收，另一部分則透過標本照射到光電檢測器上，光電檢測器將這些光信號轉換成相應的電信號，電信號經前置放大、對數放大、模數轉換等信號處理后送入微處理器進行數據處理和計算，最后由顯示器和打印機顯示結果。
微處理機還通過控制電路控制機械驅動機構X方向和Y方向的運動來移動微孔板，從而實現自動進樣檢測過程。有些酶標分析儀采用手工移動微孔板進行檢測，省去了X，Y方向的機械驅動機構和控制電路，從而使儀器更小巧，結構也更簡單 。
按照濾光方式的不同酶標分析儀可分為濾光片式酶標儀和光柵式酶標儀，下面一起來看看吧。
1.濾光片式酶標儀
濾光片式酶標儀采用濾光片來進行波長的選擇，光源發出的全波譜光經過濾光片后，大部分被過濾，只剩下濾光片本身允許的波長通過，因此只能截取特定波長進行檢測。
2. 光柵式酶標儀
光柵式酶標儀采用光柵進行分光，光源發出的全波譜光線經過光柵后，通過光柵上面分布的一系列狹縫的分光，就可以獲得任意波長的光，波長連續可調。光柵式酶標儀使用方便靈活，可選擇任意波長的光，也能進行全波長的掃描，通過全波長掃描可以獲得未知樣品的吸收峰，從而可以達到檢測未知樣品的目的。
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