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微生物是一些細小多為肉眼看不見的單細胞生物，在各種水域、空氣、土壤中到處都有它們的存在。微生物的門類有細菌、藻類、真菌和原生動物。
微生物的生長受下列因素影響:①溫度(對許多微生物來說，20~30℃最適宜);②光照強度(對藻類發生特別重要);③pH（PH儀表）值或酸堿度;④溶解氧（溶氧儀）與溶解硫化物的含量;⑤無機物(SiO2、NO2-N、NH4-N、HCO3-、PO43-、Mn、Fe等)的濃度;⑥有機物(COD或BOD)的濃度;⑦循環水的濃縮倍數。上述條件并非所有微生物都需要，每種微生物有著各自不同的要求，而且需要量也有一定的限制濃度，如好氣性環境和厭氣性環境均各有相應的菌類繁殖，具有哪種傾向的細菌發生和生長，決定于介質—水和土壤中的含氧量和無機物、有機物含量。
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