冷凍離心機主要是防止有些離心物質（如蛋白質等）在高溫下產生質變。既然要冷凍，那就必須有制冷的效果，具有冰箱的效果，因此在冷凍離心機內部要不常溫離心機加入更多的器件，比如壓縮機等等，這就大大的增加了離心機的成本。

冷凍離心機常用于大量初級分離提取生物大分子、沉淀物等。其轉頭多用鋁合金制的甩平式和角式兩種，離心管有硬質玻璃、聚乙烯硬塑料和不銹鋼管多種型號。離心機裝配有驅動電機、定時器、調整器（速度指示）和制冷系統（溫度可調范圍為-20—+40℃），可根據離心物質所需，更換不同容量和不同型號轉速的轉頭。

使用注意事項：

1、離心管一定要平衡好，放入時也要注意位置平衡。不要超過離心機的*高限轉速。

2、一定要在達到預設轉速后，才能離開離心機；若有任何異狀，要立刻停機。

3、通常聽聲音即可得知離心狀況是否正常，也可注意離心機的震動情形。

4、使用硫酸銨等高鹽溶液樣本后，一定要把儀器洗干凈，也要清理離心機轉艙。