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氟苯尼考通過抑制肽酰基轉移酶活性而產生廣譜抑菌作用，抗菌譜廣，包括各種革蘭氏陽性、陰性菌和支原體等。
氟苯尼考為氯霉素的結構同系物，作用機理及抗菌譜與氯霉素和甲砜霉素相似，能與50S亞基結合，抑制酞酰基轉移酶，從而抑制酞鏈的延伸，干擾蛋白質合成。氟苯尼考在結構上以F原子取代了氯霉素、甲砜霉素中丙烷鏈3碳位置上的-OH，阻止了細菌乙酰轉移酶在此位置上的乙酰化作用，故不受該酶影響而被滅活；而乙酰轉移酶又與細菌經質粒介導的對氯霉素、甲砜霉素的耐藥性有關，因此氟苯尼考不會產生類似氯霉素、甲砜霉素質粒介導的耐藥性, 而且對許多氯霉素耐藥菌株仍然敏感。
藥理作用：通過脂溶性可彌散進入細菌細胞內，主要作用于細菌70s核糖體的50s亞基，抑制轉肽酶，使肽酶的增長受阻，抑制了肽鏈的形成，從而阻止蛋白質的合成，達到抗菌目的。本品抗菌譜廣，對革蘭氏陽性菌和革蘭氏陰性菌及支原體均有強效。
氟苯尼考具有較廣的抗菌譜,對革蘭氏陽性菌及陰性菌皆有強大的殺滅作用,對厭氧革蘭氏陽性菌及陰性螺旋體,立克次氏體,阿米巴原蟲等均有較強的抗菌作用。
本品不引起再生障礙性貧血勿與β-內酰胺類、氨基糖苷類等藥物合用。
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