腸道是人體重要的消化器官,腸指的是從胃幽門至的消化管, 是消化器官中最長管道，人體腸道結構主要包括小腸和大腸。腸道疾病非常常見，如腸梗阻、慢性炎癥性腸病、結直腸癌等等，其中結直腸癌已成為威脅人類健康最嚴重的疾病之一。因此，腸道的研究是現在非常熱門的領域，有著廣闊的應用前景。

2009年，Hans Clevers研究團隊利用來源于腸隱窩的單個干細胞（Lgr5+）或單個隱窩結構，在體外成功培養出3D腸道“類器官”。離體的腸道干細胞或隱窩在基質膠、小分子化合物、細胞添加劑以及多種生長因子中培養可不斷增殖，具有自我更新及分化能力，能夠分化形成多種腸道成熟細胞，在腸道疾病模型建立和研究中發揮重要的作用。[1]

圖1. 單細胞在單孔中的集落形成效率[1]

1. 隱窩分離，細胞分離和細胞培養

通常在含有2 mM EDTA的PBS中，4℃下孵育30 min，從小鼠小腸中釋放隱窩。對分離的隱窩進行計數并成球。在24孔板中，加入基質膠、生長因子（10-50 ng/mL EGF、500 ng/mL R-spondin 1、100 ng/mL Noggin）孵育。

2. 分選實驗

分離的隱窩37℃孵育45 min，分離后的細胞通過孔徑為20 μm的細胞過濾器。將分選的細胞收集在隱窩培養基中，并加入含有Jagged-1多肽（1 μM）的基質膠中，每孔1個細胞（在96孔板中，含5 mL基質膠）。

3. 隱窩培養基

48孔板加入250 μL培養基，96孔板100 μL培養基，并且添加小分子化合物Y-27632（10 μM），每隔一天添加一次生長因子，每4天更換一次培養基。

4. 傳代

將類器官從基質膠中取出，機械分離成單隱窩結構域，然后轉移到新鮮的基質膠中。每1-2周進行一次，分割比例為1：5。[1]

 圖2. 腸隱窩培養系統的建立[1]

 圖3. b、c、d分別為培養第5天、14天、3周后的情況，e為隱窩樣器官的示意圖[1]

在培養小鼠結腸類器官時，培養基中需要添加p38 MAPK激酶抑制劑（SB-202190）、TGF-β抑制劑（A 83-01）、Rho激酶抑制劑（Y-27632）和GSK抑制劑（CHIR-99021）、Jagged-1等小分子化合物，以及EGF、R-spondin-1、Noggin和Wnt-3A等生長因子。[1] [2] 

研究團隊根據腸上皮細胞的生長需求來設計的這樣一個培養系統，Wnt信號傳遞是隱窩增殖的關鍵要求，而Wnt激動劑R-spondin1在體內誘導隱窩明顯增生，表皮生長因子（EGF）的信號轉導與腸道增殖有關，Noggin的轉基因表達誘導了隱窩數量的增加。Rho激酶抑制劑Y-27632抑制胚胎干細胞失巢凋亡，降低細胞死亡率。細胞間的Notch信號對于維持隱窩的增殖至關重要，我們還提供了一種Notch激動性肽（Jagged-1）。[1] [2]

2022年Hans Clevers團隊創新性地引入了IL-22來優化hSIOs培養基組成，極大地提高了腸道類器官的出芽比例，上調潘氏細胞的表達水平，更好地模擬人體內腸道的組成性表達成分。如下圖。

圖4.人結腸培養（小分子化合物Nicotinamide、SB 202190和A 83-01對培養的影響）[2]

 圖5.人結腸腺癌細胞的培養過程[2]

類器官培養和藥物刺激的hSIO培養基中需要添加的小分子化合物、添加劑和細胞因子，分別為：B-27（1%），N-乙酰半胱氨酸（1 mM），煙酰胺（10 mM），Alk 4/5/7抑制劑A 83-01（500 nM）, p38抑制劑SB 202190（3-10 μM），前列腺素E2（10 nM），CHIR-99021（3-10 μM），Rho激酶抑制劑Y-27632（10 μM）和Primocin（100 μg/mL），BP-1-102，LY294002，MK-2206，雷帕霉素，N-2，谷氨酰胺，HEPES，青霉素/鏈霉素，R-Spondin，Noggin（2%）,人EGF（50 ng/mL），人IL-22（2 ng/mL），具體如下圖所示（圖六）。[3]

1.重懸隱窩基質膠混合物，孔板中加入一定量的混合物和隱窩培養基（如24孔板可加入50 μL混合物和500 μL培養基）；
2.用離心管轉移到超凈工作臺里，PBS（含雙抗）潤洗2-3次，將腸粘膜轉移至含有EDTA（2 mM）的溶液中，置于4℃，小腸消化約30 min，結腸消化約1 h；
3.將消化好的小腸粘膜轉移至離心管中，加入PBS，搖晃均勻后用70 μm的細胞過濾篩過濾，1000 r/min室溫離心5 min，結腸隱窩無需過濾；
4.棄上清，加入培養基重懸沉淀，計數，隱窩的數量約10個/μL為佳；
5.加入一定量的懸液到離心管中，室溫離心5 min；
6.加入預冷的基質膠混合物（基質膠：培養基為2:1）重懸沉淀；
7.將重懸液按一定量接種在預熱的孔板中；

8.每個孔加入一定量的預熱的隱窩培養基，37℃培養1-2周。

9.在培養板中，每孔加入一定量的培養基，用槍頭將基質膠小心的刮出，取懸液，轉移到離心管中；
10.將要傳代的隱窩置于冰上5-10 min；
11.用槍頭吹打基質膠，反復進行，直至基質膠被打碎，中間盡量避免氣泡產生；

12.將消化好的小腸粘膜轉移至離心管中，加入PBS，搖晃均勻后用70 μm的細胞過濾篩過濾，1000 r/min室溫離心5 min，結腸隱窩無需過濾；

13.棄上清，加入培養基重懸沉淀，計數，隱窩的數量約10個/μL為佳；

14.加入一定量的懸液到離心管中，室溫離心5 min；

15.加入預冷的基質膠混合物（基質膠：培養基為2:1）重懸沉淀；

16.可按1：1 - 3：1進行傳代培養；

17.將需要凍存的類器官置于冰上5-10 min；
18.收集類器官，離心后棄上清；
19.加入凍存培養液重懸類器官，分裝至凍存管中，置于-80℃，24 h后置于液氮中長期保存。

利用腸類器官構建的體外腸道模型，可以極大的推動對腸道疾病發生發展的研究，為高通量藥物篩選、新物研發、藥物功能檢測、靶向治療、個性化精準醫療、再生醫學提供新的重要的研究平臺和途徑。腸道類器官的出現，為腸道疾病的研究和治療打開了一扇全新的大門。

[1] Sato T, et al. Single Lgr5 stem cells build crypt-villus structures in vitro without a mesenchymal niche. Nature. 2009 May 14;459(7244):262-5. doi: 10.1038/nature07935. Epub 2009 Mar 29. PMID: 19329995.

[2] Sato T, et al. Long-term expansion of epithelial organoids from human colon, adenoma, adenocarcinoma, and Barrett's epithelium. Gastroenterology. 2011 Nov;141(5):1762-72. doi: 10.1053/j.gastro.2011.07.050. Epub 2011 Sep 2. PMID: 21889923.

[3] He GW, et al. Optimized human intestinal organoid model reveals interleukin-22-dependency of paneth cell formation. Cell Stem Cell. 2022 Sep 1;29(9):1333-1345.e6. doi: 10.1016/j.stem.2022.08.002. Epub 2022 Aug 23. Erratum in: Cell Stem Cell. 2022 Dec 1;29(12):1718-1720. PMID: 36002022; PMCID: PMC9438971.