近年基因組學和表觀遺傳學領域引入了兩種新方法:
核酸酶靶向切割和釋放技術(CUT&RUN)
靶向剪切及轉座酶技術(CUT&Tag)
CUT&RUN和CUT&Tag檢測法正在取代ChIP-seq
簡化的工作流程跳過了ChIP-seq實驗法中的挑戰性步驟,包括染色質片段化和抗體pull down,用更少的細胞和測序讀數得到更佳的數據。
具體變現為:
1.低細胞需求量;
2.高吞吐量;
3.操作流程更簡易;
4.低成本,測序讀取次數更少;
5.數據質量可靠,重復性好
EpiCypher CUT&Tag:
孵育結合好特異性抗體與靶標蛋白后,加入蛋白 A、蛋白G與Tn5的復合物(pAG-Tn5),使得轉座體進入細胞并與抗體結合,間接地固定在靶蛋白上;激活Tn5酶的切割活性,將靶蛋白結合的DNA區域切斷,從而達到提取DNA、進行PCR擴增、構建文庫的目的。在Tn5上融合了protein A/G抗體結合功能域的轉座體pAG-Tn5是關鍵的進步,因為這一步允許研究者不必碎裂染色質以及進行傳統的庫準備步驟。
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