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差速離心比較簡單，離心過程中將懸混液分離成沉淀與上清液兩部分，通過倒出上清液或刮出沉淀，除去較小或較大的顆粒雜質，達到分離提取的目的。該方法多使用角轉子，離心分離的時間短，低速一般不超過0.5h，高速不超過3~4h。離心計算設計方便，實驗重復性好。
差速離心分辨能力較差，一般不能獲得理想純度，沉淀不能達回收。
對于有活性料，需要認真選擇RCF與離心時間，否則受過大離心力的壓力作用，有些顆粒受擠壓而變形甚至破裂失去活性。生物顆粒表面由于一些大分子等以三級結構相互接觸，緊緊擠壓在一起，形成不可逆的氫鍵結合、粘黏，使原有活性消失或減退，形成廢品餅子，所以形成沉淀的離心力絕不是越大越好。
差速離心中樣品的產率與純度是矛盾的，要求純度高、產率就會低。
顆粒大小和密度對沉降的影響。溶劑介質中顆粒沉降速度由r2p （ρp-ρm）決定。影響沉降的因素是顆粒大小與溶劑介質的密度。例如密度ρ大的小顆粒可能與密度ρ小的大顆粒有相似的S值。對這類顆粒就還要用密度梯度法進一步分離提純化。
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