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大腸桿菌質(zhì)粒DNA的提取

來源:深圳市安培生物科技有限公司   2023年04月19日 16:49  


實(shí)驗(yàn)方法原理堿法提取主要是利用共價(jià)閉合環(huán)狀質(zhì)粒與線性染色質(zhì)在拓?fù)鋵W(xué)上的差異來分離它們。在堿性pH環(huán)境,DNA變性,當(dāng)恢復(fù)中性并在高鹽離子濃度時(shí),絕大多數(shù)質(zhì)粒DNA可以準(zhǔn)確復(fù)性,留在上清中;而線性染色體DNA不能準(zhǔn)確復(fù)性,相互交聯(lián)纏繞附著在細(xì)胞壁碎片上與蛋白質(zhì)發(fā)生沉淀。離心后獲得大量質(zhì)粒的上清液,利用親水性有機(jī)溶劑(乙醇、異丙醇、PEG8000)使質(zhì)粒DNA脫水,離心后收集。
實(shí)驗(yàn)材料
含質(zhì)粒的大腸桿菌
試劑、試劑盒
葡萄糖 EDTA Tris-HCl NaOH SDS KAc 異戊醇
儀器、耗材
臺(tái)式高速離心機(jī) 恒溫振蕩搖床 高壓滅菌鍋 振蕩器 微量移液器 1.5ml離心管
實(shí)驗(yàn)步驟

一、試劑配制


1. LB液體培養(yǎng)基。


2. 100 mg/ml氨芐西林儲(chǔ)存液:稱取25g的氨芐西林粉末,加去離子水至250ml,全部溶解后過濾、分裝,20℃保存。


3. 溶液Ⅰ:50 mmol/L葡萄糖溶液,25 mmoi/L Tris-鹽酸(pH 8.0),10 mmol/L EDTA(pH 8 0)。1 mol/L Tris-鹽酸(pH 8.0)12.5ml,0 5 mol/L EDTA(pH8.0)10ml,葡萄糖4.730g;加去離子水至500ml,高壓滅菌,貯存于4℃。


4. 溶液Ⅱ:0.2moI/L 氫氧化鈉溶液,1% SDS(10 N 氫氧化鈉20 μl,10%SDS 100μl,加去離子水至1ml),使用前臨時(shí)配制。


5. 溶液Ⅲ(pH 4.8):5 mol/L 醋酸鉀300ml,冰醋酸57.5ml,加去離子水至500ml,4℃保存。


6. 苯酚:氯仿(1:1,V/V)(酚和氯仿均有很強(qiáng)的腐蝕性操作時(shí)應(yīng)戴手套!)。


7. 無水乙醇。


8. 70%乙醇。


9. RNase A(20 mg/ml)溶液:100 mg RNA酶干粉加5ml超純水溶解,然后在沸水煮


15min,分裝,20℃保存。


10. TE緩沖液:10 mmol/L Tris-鹽酸(pH8.0),1 mmol/L EDTA(pH8.O)。


二、實(shí)驗(yàn)方法


1. 挑取LB固體培養(yǎng)基上生長的單菌落,接種于2.0ml LB(含Amp 100 μg/ml)液體培養(yǎng)


基中。37℃、250 r/min振蕩培養(yǎng)過夜(約12——14h)。


2. 取1.5ml細(xì)菌培養(yǎng)液倒入離心管中,4℃、6000轉(zhuǎn)離心30s,棄上清,將離心管倒置于紙巾上,去除殘留液體。


3. 菌體沉淀重懸于100μl用冰預(yù)冷的溶液Ⅰ中,劇烈振蕩,使菌體分散混勻,室溫下放置5 min。


4. 加入200μl新配制的溶液Ⅱ,蓋緊管口,快速溫和顛倒離心管5——10次,以混勻內(nèi)容


物,冰浴5min。


5. 加入150μl預(yù)冷的溶液Ⅲ,蓋緊管口,溫和顛倒5——10次混勻,冰浴3——5min,4℃、6000轉(zhuǎn)離心5min。轉(zhuǎn)移上清到一個(gè)新的1.5ml Ep管中。


6. 加入等體積的酚一氯仿抽提劑,振蕩混勻,4℃、6000轉(zhuǎn),離心2 rain。


7. 小心移出上清于1.5ml Ep管中;加入2倍體積用冰預(yù)冷的無水乙醇于室溫沉淀雙鏈


DNA,混勻,室溫放置2--5rain,4℃、6000轉(zhuǎn)離心5min。


8. 棄上清,將離心管倒置于紙巾上使所有液體流出,加入1ml 70%乙醇,蓋緊離心管顛倒數(shù)次,4℃、6000轉(zhuǎn),離心2min。


9. 去除所有的乙醇溶液,將管倒置于紙巾上使液體流盡,室溫干燥5——10min,直到乙醇都揮發(fā)干凈。


10.將質(zhì)粒DNA沉淀溶于50 μl TE緩沖液(含20 μg/ml RNaseA)中,溫和振蕩數(shù)秒,-20℃儲(chǔ)存?zhèn)溆谩?/p>


注意事項(xiàng)1. 溶液Ⅰ與溶菌液充分搖勻,用力適當(dāng)。因?yàn)榇藭r(shí)細(xì)菌還沒有與堿和SDS作用,染色體DNA尚未釋放,不必?fù)?dān)心其分子斷裂,一般可用力振蕩幾次。


2. 加入SDS后則要注意不能過分用力振蕩,溫和混勻,但又必須讓它反應(yīng)充分。


3. 加入溶液Ⅱ混勻之后,一定要在冰上放置,不要搖動(dòng),對于溶液Ⅲ同樣處理。


深圳安培生物科技有限公司,是一家具有核心的技術(shù)實(shí)力、壹流的經(jīng)營管理水平和完善的市場銷售體系的生物高科技企業(yè)。總部設(shè)在廣東,服務(wù)面向全國。安培生物集進(jìn)口試劑、實(shí)驗(yàn)室耗材銷售、技術(shù)服務(wù)與合約開發(fā)為一體的專業(yè)化高科技公司,旨在為生命科學(xué)的發(fā)展提供壹流的產(chǎn)品與服務(wù)。本公司建立了涵蓋分子生物學(xué)、細(xì)胞生物學(xué)、免疫學(xué)、信號傳導(dǎo)和神經(jīng)科學(xué)等領(lǐng)域的產(chǎn)品供應(yīng)線,在各個(gè)領(lǐng)域內(nèi)向用戶提供世界前沿水平和質(zhì)量穩(wěn)定的產(chǎn)品,安培生物致力于為廣大的科研機(jī)構(gòu)、高等院校等優(yōu)質(zhì)客戶提供優(yōu)質(zhì)的產(chǎn)品、技術(shù)支持與服務(wù)。


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