當公司期望為增加產量而使用非均相系統來擴大生產規模時，通常會使用更高的磁力來分離磁珠。所導致的結果是，最靠近磁體的那部分磁珠受到的力非常大。另外，當體積增加時，分離時間也會大大增加，以便在不均勻磁力分布的系統中收集到可接受比例范圍內的磁珠。實際上，系統中使用的磁體越大，想要獲得與較小生產規格相同或相似的磁珠產量，所耗費的分離時間反而越長。

較長的分離時間再加上暴露于很高的磁力環境中，會導致磁珠不可逆的聚集板結團塊增加形成。這個問題會造成產量降低，并迫使操作人員采取一些非常規的重懸方法，例如使用超聲處理。為了重懸這些團塊而進行的超聲處理會增加分離過程的步驟，從而導致生產批次的時間更長，過程中投入的時間和金錢也更多，這就使得整個開發過程所需的時間更長以及需要更多的資源來驗證處理。

您可以通過使用足夠低的力來嘗試避免這些問題，這樣就不會隨著時間的延長將磁珠暴露于如此高的磁力之下。但是對于使用非均相的磁性分離系統時，要么大大增加磁珠的損耗，要么指數級的延長分離時間。但使用均相磁性分離系統，既可以減小對磁珠的作用力，又可以減少分離時間。這些系統中的分離時間與容器的直徑成正比。 由于使用力小且分離時間短，因此在使用均相生物磁分離系統時可以成功避免不可逆的聚集問題。