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生物技術的發展日新月異，隨著PCR技術和基因測序技術在各個領域的應用，包括醫學方面疾病檢測、農業方面轉基因檢測以及其他很多方面的應用等，高通量的樣本核酸提取已經變得極為迫切，很多公司推出了全自動核酸提取的儀器，各種原理的都有，亂花漸欲迷人眼。如何選擇一款合適的核酸自動提取儀，需要細細分析。
從提取原理上來看，主要有離心柱法、磁珠法；離心柱法全自動核酸提取儀采用離心機和自動移液裝置想結合的方法，通量一般在1-12個樣本，時間上和手工提取差不多，并不能提高效率，價格也不便宜，耗材還不通用，主要是難以滿足檢測市場大量樣本的高通量提取的需求。
基于磁珠法應用的核酸提取儀，市場常見產品的通量有8、16、32、96通道，相對于移液法，磁棒法的優點是每一步的液體不殘留，因為磁棒只帶走結合有核酸的磁珠，轉移到下一個步驟相應的反應孔中；另外選擇磁棒法的提取儀器好要功能更齊全的，比如可以加熱，每個加熱槽好獨立溫控，這樣可以設置裂解、洗脫的不同溫度；另外很重要的一點是，帶動磁棒的電機和結構要確保執行快速混勻和攪拌動作的情況下能長期穩定運行，確保實驗結果的準確性。磁棒法的通量常見為32通道，96通道，96通道的選擇比較適合大量樣本提取，因其同時運行96個孔，樣本量少的話，會產生耗材的浪費，增加使用成本；而32通道的處理量相對偏少，加上對照組，往往同時檢測量在24個樣本左右；而且32通量的設備市場競爭激烈，市場比較混亂。
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