內毒素耐受狀態下細胞因子和類二十烷酸的合成確實存在改變，但是這種變化的詳細過程并未闡明。

環氧化酶產物似乎在內毒素耐受狀態的形成中并無作用，因為在家兔的實驗中，吲哚美辛治療并不能抑制巨噬細胞內毒素耐受狀態的形成，腫瘤壞死因子可誘導出對內毒素的抑制。不管是內毒素還是腫瘤壞死因子誘導的耐受狀態，腫瘤壞死因子的合成量均減少。前列腺素E2、霍亂毒素和dibutyryl c-AMP能夠在轉錄水平抑制內毒素誘導的腫瘤壞死因子合成。Zuckerman等認為，在內毒素耐受狀態下，轉錄后和翻譯水平的控制或許也有改變，因為腫瘤壞死因子mRNA和腫瘤壞死因子前體的免疫沉淀反應物都增加了，但是腫瘤壞死因子的產量卻減少了。

Freudenbergh和Galanos等推測在內毒素的刺激下，巨噬細胞能夠合成“耐受因子”。白細胞介素-1受體拮抗劑能夠抑制內毒素耐受的形成，抑制集落刺激因子的產生。在小鼠實驗中，在內毒素刺激下，巨噬細胞也是轉移生長因子-β（TGF-β）的主要來源，它在小鼠確實能夠誘導出內毒素的耐受狀態；白細胞介素-6和轉移生長因子-β使內毒素血癥大鼠的支氣管肺泡灌洗液中腫瘤壞死因子-α的水平降低。在肺成纖維細胞的實驗中，轉移生長因子-β顯示出調節白細胞介素-6基因轉錄的功能。

看來，機體形成對內毒素耐受狀態的機制多樣而復雜，隨著對巨噬細胞中內毒素信號傳輸通路的詳盡闡明，必將完-全揭曉內毒素耐受狀態形成的機制。