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凍干機發展至今，其種類也逐漸增多。按其功能劃分，可分為：普通型凍干機、壓蓋型凍干機、多歧管普通型凍干機、多歧管壓蓋型凍干機、T型架凍干機、原位型凍干機。
①普通型凍干機：適合大多數常規實驗，物料可散裝于物料盤內進行冷凍干燥；
②壓蓋型凍干機：自帶壓蓋裝置，物料可散裝于物料盤進行干燥，也可針對西林瓶裝物料的干燥，干燥結束后手動操作壓蓋裝置壓緊瓶蓋，使西林瓶樣品在真空環境下進行密封，避免二次污染、重新吸附水分；
③多歧管普通型凍干機：干燥室外部連接8個燒瓶，燒瓶各自連接干燥室，也可通過對應開關控制單獨切斷相應燒瓶與干燥室的連接，可按需要隨時取下或裝上燒瓶，不需要停機。干燥室內可以進行常規藥品凍干，燒瓶內也可以物料干燥實驗，適合觀察物料在不同干燥時間下的變化情況，便于研究實驗室課堂的授課；
④多歧管壓蓋型凍干機：干燥室外部連接8個燒瓶，且自帶壓蓋裝置。既適合常規樣品干燥、以及使用燒瓶干燥研究物料變化過程，又可以針對西林瓶裝物料進行干燥并在真空下直接進行壓塞密封操作；
⑤T型架凍干機：適用于安瓿管、安瓿瓶裝物料干燥。對細菌，真菌等微生物菌種的保藏，實驗室常采用安瓿封存法。樣品冷凍干燥后封裝在小安瓿內。它具有保藏期長、變異小，便于大量保藏及適用范圍較廣等優點。便于實驗室、科研的樣品干燥實驗，凍干過程可拆卸觀察；
⑥原位型凍干機：原位預凍、原位干燥。它改變了傳統凍干機干燥過程的人工繁瑣操作，防止了物料的污染，實現了干燥升華的自動化。
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