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不同的氨基酸帶有不同化學性質的側鏈基團，有的帶有堿性側鏈，有的帶有酸性側鏈，由此組成的蛋白質具有不同數目的堿性基團和酸性基團，這些基團會使蛋白質在不同的pH溶液中帶有不同的凈電荷,整個蛋白質分子帶正電荷多,即為堿性蛋白(等電點偏向酸性);整個蛋白質帶負電荷多，即為酸性蛋白質（等電點偏向酸性)。酸性蛋白染色液是利用酸性蛋白質與帶有正電荷的酸性染料固綠結合進行染色，細胞中含量較為豐富的酸性蛋白主要存在于細胞質和核仁中，因此染色后細胞質和核仁大部分被染成綠色。
酸性蛋白染色液相關使用注意事項：
1、涂片應厚薄均勻，以免影響染色效果。
3、酸性分化液孵育后，沖洗應*底，否則會干擾固綠的染色。
4、染色過深可用甲醇或酒精適當脫色，盡量不復染。
5、pH值對染色有一定影響，載玻片應清潔、無酸堿污染，以免影響染色效果。6、為了您的安全和健康，請穿實驗服并戴一次性手套操作。
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