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QX200數字PCR儀采用QX200微滴發生器將含有核酸分子的反應體系形成成千上萬個納升級的微滴，其中每個微滴或不含待檢核酸靶分子，或者含有一個至數個待檢核酸靶分子，且每個微滴都作為一個獨立的PCR反應器。
經PCR擴增后，采用微滴閱讀儀逐個對每個微滴進行檢測，根據熒光信號的有無判斷該微滴是否含有待檢靶分子。在泊松分布原理的基礎上，根據陽性微滴的比例，分析軟件可計算給出待檢靶分子的濃度或拷貝數。
注意：
1.儀器安置：QX200數字PCR儀應安放在濕度較低、灰塵較少并遠離水源和熱源的地方，且無腐蝕性氣體或強磁場干擾。環境溫度建議在18——35℃之間。儀器之間應保持50cm 以上距離，以降低儀器之間的影響。
2.儀器清潔：平時用95%乙醇或10%清洗液浸泡樣品池5min，然后清洗被污染的孔；用微量移液器吸取液體，用棉簽吸干剩余液體；打開PCR儀，設定保持溫度為50℃的PCR程序并使之運行，讓殘余液體揮發去除。一般5～10min即可。如果儀器出現熒光污染，需要用壓縮空氣或純水清洗墊蓋底面，確保樣品池的孔干凈，無污物阻擋光路。
3.更換保險絲：若PCR儀出現故障，可先將PCR儀關機，拔去插頭，打開電源插口旁邊的保險盒，換上備用的保險絲，觀察是否恢復正常。
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