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常用流動相可以使用下述緩沖溶液或者氯化鈉、硫酸鈉、硫酸鉀等鹽溶液。而且也可以在緩沖溶液中添加鹽。總鹽濃度一般為20 mM ~ 1 M。
乙二醇和2-丙醇等極性有機溶劑，可以上限為20 % (v/v)。
梯度洗脫時請按下述順序進行色譜柱的平衡。
緩沖液A(低離子強度)通夜10 mL。
緩沖液B(高離子強度)通夜40 mL置換成正確的反離子。
緩沖液A通夜15 mL平衡。
IEC QA-825、DEAE-825作為流動相使用的緩沖溶液，必須和緩沖離子具有相同的正電荷，且在使用的pH條件下有足夠的緩沖能力。
| pH range | Buffer |
|---|---|
| 4.8 - 5.0 | N-Methylpiperazin·HCl |
| 5.0 - 6.0 | Piperazine·HCl |
| 5.5 - 7.3 | Bis-Tris*1·HCl |
| 6.4 - 7.3 | Bis-Tris Propane*2·HCl |
| 7.3 - 7.7 | Triethanolamine·HCl |
| 7.5 - 8.0 | Tris·HCl |
| 8.0 - 8.5 | N-Methyldiethanolamine·HCl |
| 8.4 - 8.8 | Diethanolamine·HCl |
| 8.5 - 9.0 | 1,3-Diaminopropane·HCl |
| 9.0 - 9.5 | Ethanolamine·HCl |
- *1 2-bis(2-hydroxyethyl amino-2-(hyroxymethyl)-13-propanediol)
*2 1,3-bis(tris(hydroxymethyl)methylamino)propane
IEC SP-825、CM-825作為緩沖液使用的流動相，必須和緩沖離子擁有相同的正電荷，且在使用時的pH條件下有足夠的緩沖能力。
| pH range | Buffer |
|---|---|
| 3.8 - 4.3 | Sodium Formate |
| 4.3 - 4.8 | Sodium Succinate |
| 4.8 - 5.2 | Sodium Acetate |
| 5.0 - 6.0 | Sodium Malonate |
| 5.5 - 7.0 | 2-(N-morpholino)ethanesulfonic acid (MES) |
| 6.7 - 7.6 | Sodium Phosphate |
| 6.8 - 8.2 | 2-[4-(2-Hydroxyethyl)-1-piperazinyl]-ethanesulfonic acid (HEPES) |
| 7.7 - 9.1 | N,N-Bis(2-hydroxyethyl) glycine (BICINE) |
| 8.6 - 10.0 | 2-(cyclohexylamino)ethanesulfonic acid (CHES) |
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