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毛細管柱是由玻璃或石英玻璃管制成的色譜柱。內徑一般不超過 0.53 mm，長度在數十米到百米之間，管內壁經過改性并涂有固定液。
毛細管柱的特點：
1、滲透性好
一般毛細管的比滲透率約為填充柱的100倍，在同樣的柱前壓下，氣相色譜儀可使用更長的毛細管柱，而載氣的線速可保持不變。
2、相比大
相比大，傳質快，有利于提高柱效。K值小有利于快速分析。毛細管柱的液膜厚度小，柱效高，柱滲透性大，因此可采用較高流速，縮短分析時間。
3、總柱效高
從單位柱長的柱效看，毛細管柱和填充柱處于同一數量級，但毛細管柱的長度比填充柱長，因此其總柱效遠高于填充柱，大大提高分離復雜混合物的能力。總之，毛細管柱滲透性大，可采用長柱子和高載氣流速縮分析技術，使其保持高柱效和快速分離。
4、柱容量小
毛細管柱允許的進樣量小，對進樣和檢測技術要求更高，需要采用分流進樣和尾吹氣路。
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