微波消解涉及到的環境樣品包括土壤、固體垃圾、煤、煤飛灰、海洋沉積物、淤泥、廢水等。許多環境樣品都是經過復雜作用，沉積后的產物，基體成分復雜，既有重金屬又有農藥殘留，由于環境樣品的多樣性、基體的復雜性，針對被測組分和測試手段的不同，需要查詢大量的文獻資料以確定樣品性質及所需的消解試劑。環境樣品中通常含有一些有機物，常壓下用酸不易消解，而密閉微波消解能夠很好地解決這一問題，另外，一些易揮發元素也不會造成損失。

微波消解已經廣泛應用于環境樣品的金屬元素分析中，用微波消解法測定固體廢棄物中元素的方法（USEPA3051），通過大量實驗考查了精密度和準確度，驗證了微波消解的可靠性。
化學需氧量（COD）是水質監測的主要指標之一，經典的方法為重鉻酸鉀回流法，但其消耗樣品和試劑較多，回流時間長（大于2h），而采用微波消解技術省時，速度快。
非金屬元素的研究主要集中在硫、氮、磷。利用微波加熱壓力消解，一次可同時完成10多個樣品的消解，與常規分析方法相比，分析速度大大提高。
微波消解是一種先進、高效的樣品處理方法，能夠很好地滿足現代儀器分析對樣品處理過程的要求，尤其在易揮發元素的分析檢測中更具有優勢