當前DNA合成儀的主要生產廠商都致力于機器性能的完善和應用領域的開拓以及率、高產率的儀器的開發與研究。

中國臺灣科學委員會“基因醫藥衛生科技研究計劃”中的基因生物技術組已經成功研發**臺高密度復制DNA合成儀，可以同時合成384條不同DNA，每日可合成768條DNA，并可以配合聚合酶連鎖反應裝置，大量復制各種基因，不但節省時間，也可節省大量人力，這部機器能復制動物、人體、植物的基因甚至是防偽基因。

由于人們所需要的大部分核酸的堿基對數量遠遠超過目前DNA合成儀可以合成的zui長核酸鏈的堿基對數量，因此還需要不斷改善合成工藝才能得到較長的核酸分子。

為了能夠在將來改變酶的結構，使其在工業上更有價值；改變蛋白質和多肽的結構，制備新藥物；并開拓有關人類疾病和遺傳調控的新領域，化學合成DNA在這一過程中將起關鍵性作用。根據不同化學方法研制的DNA合成儀也將不斷涌現，能夠突破現有核酸合成的堿基對數量限制，大量節省人力、物力、財力。