PAE-PEG-CHEMS（聚(β-氨基酯)-聚乙二醇-半琥珀酸膽固醇）在基因治療領域雖然具有廣泛的應用前景，但也存在一些局限性。

一、生物相容性與安全性問題

免疫反應：

盡管PAE-PEG-CHEMS作為載體材料在一定程度上能夠減少免疫系統的識別，但仍然存在引發免疫反應的風險。這可能導致治療效果降低，甚至對患者造成進一步的傷害。

毒性問題：

長期或大量使用PAE-PEG-CHEMS作為基因遞送載體，可能會在體內積累并產生毒性作用。這需要對載體的毒性進行嚴格的評估和控制。

二、遞送效率與穩定性

遞送效率受限：

盡管PAE-PEG-CHEMS具有增強基因遞送效率的潛力，但在實際應用中，遞送效率可能受到多種因素的影響，如細胞類型、疾病狀態、載體濃度等。這可能導致治療效果不穩定或難以達到預期。

基因穩定性問題：

在遞送過程中，基因可能受到體內酶的作用而發生降解或失活。盡管PAE-PEG-CHEMS具有一定的保護基因免受降解的作用，但這種保護作用可能并不一定有效。

三、載體設計與制備復雜性

載體設計挑戰：

設計合適的PAE-PEG-CHEMS載體需要充分考慮其化學結構、靶向性、穩定性以及生物相容性等多個方面。這增加了載體設計的復雜性和難度。

制備工藝要求高：

PAE-PEG-CHEMS載體的制備需要嚴格的工藝控制和質量控制。這包括載體的純度、濃度、穩定性等方面的檢測和控制。制備工藝的復雜性和高要求可能限制了其在實際應用中的推廣。

四、疾病類型與治療方案的限制

疾病類型限制：

并非所有類型的疾病都適合采用PAE-PEG-CHEMS作為基因遞送載體。例如，對于某些需要高效、快速遞送的疾病，PAE-PEG-CHEMS可能無法滿足要求。