微生物是生態環境的重要組成部分，而且與工農業生產和人們的日常生活密切相關，在食品、醫藥、農業生產和環境保護等方面具有廣泛的應用，微生物產業已成為繼植物、動物之后的第三大生物產業。微生物為生物技術的發展更是提供了基本材料和豐富的基因資源，也是生物技術產業的重要開發對象。

　　農業微生物是與農業生產(農作物種植業、畜禽飼養業和水產養殖業)、農產品加工、農業環境保護和農業生物技術有關的微生物的總稱。微生物菌種資源是指可培養的、有一定科學意義或實用價值的細菌、真菌、病毒、細胞株及相關的信息資料。近幾十年來，微生物肥料、微生物農藥、微生物調節劑、土壤和環境修復劑、飼料添加劑等農業微生物產品迅速發展，成為發展生態農業、循環農業的重要途徑。因此，農業微生物菌種資源是國家重要生物資源之一，不僅是農業微生物科學研究、農業微生物產業及農業生物技術產業發展的基礎，而且也是整個農業可持續發展的重要基礎。