蛋白質組（Pro-teome）一詞， 源于蛋白質（Prome）與基因組（genotme）兩個詞的雜合，意思是指一種 基因或一種生物、一個細胞（組織）所表達的全套蛋白質。

   通俗地說，就是蛋白質是基因功能的執行者。因此，對蛋白質結構、定位和對蛋白質與蛋白質之間相互作用的研究將為闡明生命現象的本質提供直接的基礎。所以人們在研究基因、單基因組之后感覺到，不研究蛋白質和蛋白質組，不可能揭示與闡述基因的功能，更多地去發現疾病的診斷標志、預防標志以及藥物篩選的靶標和疾病治療的靶標。

   開展蛋白質組研究工作是科學界延續了數十年的一個夢想，因為人類的大多數疾病是由于蛋白質異常造成的。二維電泳、新型質譜技術及各種先進的信息和網絡技術為科學家掌握蛋白質表達規律提供了有力支撐，在人類基因組研究實現劃時代飛躍的時代的今天，蛋白質組學便被推上了前臺。當然蛋白質組要比基因組復雜的多。基因組圖只有一張而蛋白質組圖要每個器官就有一張，工作更艱巨、更復雜。