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Xl1-Blue菌株
基因型：
endA1 gyrA96（nalR） thi-1 recA1 relA1 lac glnV44 F'[Tn10 proAB+ lacIq Δ（lacZ）M15] hsdR17（rK- mK+）。
特點：
具有卡那抗性、四環素抗性和氯霉素抗性。
用途：
分子克隆和質粒提取。
BL21（DE3）菌株
基因型：
F- ompT gal dcm lon hsdSB（rB- mB-） λ（DE3 [lacI lacUV5-T7 gene 1 ind1 sam7 nin5）。
特點：
該菌株用于以T7 RNA聚合酶為表達系統的外源基因的蛋白表達宿主。T7噬菌體RNA聚合酶基因的表達受控于λ噬菌體DE3區的lacUV5啟動子，該區整合于BL21的染色體上。該菌適合于非毒性蛋白的表達。
用途：
蛋白質表達。
BL21（DE3）ply菌株
基因型：
F- ompT gal dcm lon hsdSB（rB- mB-） λ（DE3） pLysS（cmR）。
特點：
該菌株帶有pLysS,具有氯霉素抗性。此質粒還有表達T7溶菌酶的基因，T7溶菌酶能夠降低目的基因的背景表達水平，但不干擾IPTG誘導的表達。 適合于毒性蛋白和非毒性蛋白的表達。
用途：
蛋白質表達。
DH5α菌株
基因型：
F- endA1 glnV44 thi-1 recA1 relA1 gyrA96 deoR nupG Φ80dlacZΔM15 Δ（lacZYA-argF）U169, hsdR17（rK-, λ-）。
特點：
一種常用于質粒克隆的菌株。 其Φ80dlacZΔM15基因的表達產物與pUC載體編碼的β-半乳糖苷酶氨基端實現α互補，可用于藍白斑篩選。recA1和 endA1的突變有利于克隆DNA的穩定和高純度質粒DNA的提取。
用途：
分子克隆、質粒提取和蛋白質表達。
JM109菌株
基因型：
endA1 glnV44 thi-1 relA1 gyrA96 recA1 mcrB+ Δ（lac-proAB） e14- [F' traD36 proAB+ lacIq lacZΔM15]hsdR17（rK-mK+）。
特點：
部分抗性缺陷，適合重復基因表達， 可用于M13克隆序列測定和藍白斑篩選。
用途：
分子克隆、質粒提取和蛋白質表達。
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