在現代顯微鏡的應用中，已不僅需要顯微照相和顯微描繪，在很多情況下，更需要對顯微鏡標本進行定量測定。同時，除了線性大小這個早已被測定的參數外，對于一個物體的面積、休積及標本中某些特異物質的光譜吸收特性等參數，都需要被測定。

通常用于測量一個物體幾何量度的方法被稱為形態度量分析，同時，這種測量更可以用很簡單的裝置和方法進行，但是現在已制造出專門的精密儀器，顯微鏡測量技術的應用可對這些形態度量參數進行自動或半自動的分析。
在聚焦平面上的長度側量

運用目鏡測微尺和物臺測微尺。通常在物體平面上長度的測量是運用目鏡測微尺和物臺測微尺進行的。目鏡測微尺是放在目鏡中間像平面上刻有精細刻度的玻璃圓片，圓片中間有一條直線，一般被劃分為100個小格。利用它在測量標本中聚焦平面上的某段距離時，例如一個細胞核的直徑，把這個細胞核的一端對準測微尺的一個格線，就可以測量出細胞核兩端刻度之間的距離。同時，在使用一般的高倍物鏡測量時，由于物鏡的性能和目鏡的場曲率的限制，應只使用測微尺的中間部分。如所測得的細胞核長直徑為8.5個刻度，這也只是一個相對單位，它并不能表示準確的長度，所以，這里就必須借助于一個物臺測微尺來確定目鏡測微尺每個小格所代表的長度值。測定的方法通常是把物臺測微尺放在物臺上，用測定物體所使用的同鏡測量時，由于測量顯微鏡的性能和目鏡的場曲率的限制，應只使用測微尺的中間部分。

同時用測定物體所使用的同樣放大倍數的物鏡聚焦，使兩個測微尺的刻度都較為清晰，再通過移動機械物臺和轉動目鏡使兩者移至平行靠攏并且對齊焦點。