甘薯貯藏期的管理主要是根據安全貯藏的條件，調節內窖內的溫度、濕度，其中溫度是主要條件。
一、前期以降溫排濕為主
從種薯入窖至小雪，窖內溫度較高，薯塊處于呼吸旺盛期，散發出大量的水氣、二氧化碳和熱量，應注意降溫、通風散濕、不蓋窖口、控制溫度在12---15℃左右，相對濕度在80%—90%為宜，測試薯堆溫度應測試薯堆內部，測的時間在中午。
二、中期以防寒保溫為主
從小雪到立春，窖內溫度較低，薯塊呼吸作用減弱，產生熱量少，管理要點是防寒、保溫、保濕。當薯堆內溫度降到15℃左右，要加強覆蓋，掛好門簾堵嚴同氣口。必要是在窖頂加蓋干草，加厚土層，保持10—12℃的堆溫，相對濕度在85%左右，貯藏中期測試濕度應在薯堆外部，測的時間在早晚。
三、后期以穩定窖溫為主
從2月下旬到出窖，窖外溫度逐漸回升，但經常有寒流，氣溫變化，薯塊經長期貯藏、呼吸微弱、經不住窖溫過大變化，故以穩定窖溫為主。窖溫應維持在12--15℃。保持相對濕度在85%左右。濕度過大時，選晴天中午，大氣溫高于11℃時通風散濕。