11月19日,深圳國家基因庫宣布“千種魚轉(zhuǎn)錄組計劃”(Fish T1K)正式啟動。該項目旨在解密魚類起源、進(jìn)化、生殖、發(fā)育、性別調(diào)控和免疫等活動機(jī)制,以更好應(yīng)對魚類育種、疾病防控、海洋食品安全和生物多樣性保護(hù)等帶來的諸多挑戰(zhàn)。項目計劃在未來3~5年內(nèi)完成約1000種魚類轉(zhuǎn)錄組的測序、組裝工作,并構(gòu)建高質(zhì)量的魚類轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)信息平臺。
相對于其他魚類轉(zhuǎn)錄組研究,千種魚轉(zhuǎn)錄組計劃規(guī)模大、學(xué)科交叉廣、綜合性強(qiáng),在范圍內(nèi)尚屬*。
該項目產(chǎn)出的所有數(shù)據(jù)將通過國家基因庫公開,以保證科學(xué)家可以實(shí)時掌握魚類研究動態(tài)及RNA-seq測序技術(shù)的應(yīng)用。
據(jù)介紹,到目前為止,僅有約10種魚類的基因組被公開報道。此外,在NCBI公共數(shù)據(jù)庫中僅有80多種魚類轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)。
國家基因庫海洋分庫負(fù)責(zé)人、該項目帶頭人孫穎認(rèn)為:“T1K項目將建立*專門針對魚類組學(xué)研究的性合作網(wǎng)絡(luò),并將大大深化我們對魚類的比較生理學(xué)、生物地理學(xué)認(rèn)識,促進(jìn)魚類資源醫(yī)用價值的挖掘、經(jīng)濟(jì)和生態(tài)價值的開發(fā),以及生物多樣性保護(hù)等問題的解決。”
《中國科學(xué)報》 (2013-11-21 第1版 要聞)
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