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454(GS FLX系統(tǒng))超高通量測序服務|實驗技術服務

來源:上海拜力生物科技有限公司   2015年05月21日 08:55  

關鍵詞:454(GS FLX系統(tǒng))超高通量測序服務|實驗技術服務
簡介:世界*品牌454(GS FLX系統(tǒng))超高通量測序服務|實驗技術服務原裝,質(zhì)量保證,*。
454(GS FLX系統(tǒng))超高通量測序服務|實驗技術服務——pCzn1質(zhì)粒+Arctic Express宿主菌低溫表達體系。
我們具備豐富的蛋白表達設計經(jīng)驗及實驗操作技巧,承諾客戶不成功不收費。在獲得重組蛋白產(chǎn)品的同時,我們也會提供相應的原始數(shù)據(jù)和原始圖片,不需要再額外花費精力重復實驗。另一方面,我們所有的實驗數(shù)據(jù)真實可信,我們提供原始的表達菌株和克隆質(zhì)粒,客戶可以依據(jù)我們的實驗報告重復我們的實驗結果。
產(chǎn)品品牌:454(GS FLX系統(tǒng))超高通量測序服務|實驗技術服務   http://www.。。com/goodsid/fenleiyi/2868603/1.html
實驗描述               
測序實驗流程:
1、文庫制備:根據(jù)樣品的種類和實驗目的,將基因組DNA/cDNA片段化處理至400-800bp間,經(jīng)末端修復與特異性接頭連接等修飾后變性處理回收單鏈的DNA(sstDNA);
Roche <wbr>454(GS <wbr>FLX <wbr>Titanium <wbr>System)超高通量測序技
2、Emulsion  PCR:特定比例的單鏈DNA文庫被固定在特別設計的DNA捕獲磁珠上,使大部分磁珠磁珠攜帶了一個*的單鏈DNA片斷。磁珠結合的文庫被擴增試劑乳化,形成油包水的混合物,每個*的片斷在自己的微反應器里進行獨立的擴增,而不受其他的競爭性或者污染性序列的影響。整個片段文庫的擴增平行進行。擴增后產(chǎn)生了幾百萬個相同的拷貝。隨后,乳液混合物被打破,擴增后仍結合在磁珠上的片段既可被回收純化用于后續(xù)的測序實驗;
Roche <wbr>454(GS <wbr>FLX <wbr>Titanium <wbr>System)超高通量測序技
3、測序反應:攜帶DNA的珠子與其他反應物混合物,隨后放入PTP板中進行后繼的測序。PTP孔的直徑(29um)只能容納一個珠子(20um)。然后將PTP板放置在GS FLX中,測序開始。每一個與模板鏈互補的核苷酸的添加都會產(chǎn)生化學發(fā)光的信號,并被CCD照相機所捕獲;
Roche <wbr>454(GS <wbr>FLX <wbr>Titanium <wbr>System)超高通量測序技
4、數(shù)據(jù)分析:GS FLX系統(tǒng)在10小時的運行當中可獲得100多萬個讀長,讀取超過4-6億個堿基信息,通過GS FLX系統(tǒng)提供兩種不同的生物信息學工具對測序數(shù)據(jù)進行分析。
技術特點:
? 速度快,一個測序反應耗時10個小時,獲得4-6億(400-600M)個堿基對。比傳統(tǒng)的Sanger測序的方法快100倍;
? 讀長長,單個序列的讀長更長,平均可達到450個堿基左右;
? 通量高,每個反應可以得到超過100萬個序列讀長,成本大大降低;
? 準確度高,讀長超過400bp時,單一讀長的準確性可以超過99%;
? 一致性好,測序結果一致性超過99.99%;
? 可以進行Pair-End測序研究;
? 簡便,不需要進行建庫、克隆挑取、質(zhì)粒提取等工作,一個人可以在一天內(nèi)完成一個微生物物種的測序工作。
GS FLX系統(tǒng)的應用
全基因組測序
多達120 Mb的未知基因組的測序
-生成基因組結構概圖
-研究DNA序列的組織,分布和信息
-基因篩查:尋找新基因,定位和功能
-和其他基因組進行比較研究
全基因組進行測序,例如微生物基因,BAC和YAC克隆測序。
比較基因組研究
-識別單堿基突變
-識別突變熱點和保守區(qū)域
-識別插入或者缺失的基因
-斷定基因型和表型之間的相關關系(比如,研究藥物抗性的遺傳基礎)
- 基于基因測序變化進行毒性預測
-進行流行病學分析
-了解工業(yè)生產(chǎn)菌株和它們的親代菌株序列上的差異作為進行工業(yè)生產(chǎn)菌株開發(fā)的遺傳基礎
-進行宏基因組 (metagenomics)研究
-古代化石DNA 測序研究
利用配對末端方法(Pair-End Tag)將Contigs拼接成Scaffolds。
轉錄組和基因調(diào)節(jié)研究
基于短Tags,ESTs, ChIP,或者GIS-PET序列的高通量轉錄組分析,或者miRNA 序列的基因組范圍識別,小分子和非編碼RNA的測序。
研究DNA的甲基化模式來進行基因調(diào)節(jié)的研究。
擴增產(chǎn)物分析
PCR產(chǎn)物的超精細測序(應用于醫(yī)學研究的重測序)
-在混合的腫瘤樣本中識別體細胞突變
-在群體水平上發(fā)現(xiàn)高可信度的SNP位點

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