安裝16 cm 長的電泳玻璃板和1. 5 mm 厚的墊片。在40 ml 低離子強度凝膠混合液中加100 μl 30%的過硫酸銨及34 μl TDMED，灌入玻璃板之間，插入齒寬≥7 mm 的梳子。讓膠聚合20 min。將梳子和底邊的墊片取出。將膠放入盛有低離子強度電泳緩沖液的電泳漕中，用雙頭泵以5~30 ml/min 循環電泳緩沖液。
在微量離心管中，加終體積15 μl 的下列成分：10 000 c/min 的DNA探針，終濃度300 μg/ml BSA，及取自緩沖液中的粗制蛋白提取物中的大約15 μg 蛋白質。混勻，置30℃水浴15 min。在1個加樣孔加入少量10×加樣緩沖液并讓染料跑進膠。在其他孔中加各結合反應液，在約30~35mA下電泳，直至溴酚藍（相當于約70 bp 的條帶）達到膠底。
卸下凝膠電泳裝置，撬開電泳玻璃板，將粘附了凝膠的玻璃板平放在實驗臺上，在膠上放置3張Whatman 3MM濾紙。將濾紙連同凝膠一起揭下。用塑料薄膜包裹凝膠進行真空干燥。在不使用增感屏的條件下，凝膠膜放射自顯影，或用增慼屏放射自顯影2~3 h。DNA復合物的清晰電泳條帶。
實驗材料        質粒DNA
試劑、試劑盒    dNTPDNA聚合酶Klenow酶TETAE溴化乙錠TEMED過硫酸銨BSA