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無標(biāo)記定量技術(shù)(LFQ):原理、應(yīng)用與最新進展檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹

引言:為何越來越多科研人員選擇LFQ?

在蛋白組學(xué)研究中,“定量”不僅是對蛋白存在與否的判斷,更是對其在不同生理或病理狀態(tài)下表達變化的jīngzhǔn刻畫。傳統(tǒng)的同位素標(biāo)記方法如TMT、iTRAQ雖然靈敏度高,但成本較高、流程復(fù)雜。無標(biāo)記定量技術(shù)(Label-Free Quantification, LFQ)以其樣品處理簡便、適合大規(guī)模分析、可自由組合樣本等優(yōu)勢,逐漸成為dànbáizhì組定量研究的主流。


一、LFQ的基本原理:利用質(zhì)譜信號強度或譜圖數(shù)量定量

LFQ依賴高分辨率質(zhì)譜(如Orbitrap)對樣品進行數(shù)據(jù)采集,無需化學(xué)或代謝標(biāo)記,即可通過以下兩種策略進行蛋白定量:

1、MS1信號強度(Intensity-Based Quantification)

每個肽段在一級質(zhì)譜(MS1)中具有特定的峰面積或離子強度,可以反映其相對豐度。


2、譜圖計數(shù)法(Spectral Counting)

通過統(tǒng)計肽段在MS2中被識別的次數(shù)(PSM數(shù)量)作為豐度的替代指標(biāo),適用于高豐度蛋白的定量比較。


百泰派克生物科技基于MaxQuant + Perseus等主流平臺,整合信號強度與譜圖計數(shù)兩類策略,為客戶提供高重復(fù)性、低噪聲的無標(biāo)記定量技術(shù)LFQ數(shù)據(jù)。


二、LFQ的技術(shù)流程全解析

為了獲得可靠的定量結(jié)果,LFQ通常包括以下關(guān)鍵步驟:

1、樣本制備

(1)統(tǒng)一蛋白濃度

(2)yídànbáiméi酶解成多肽

(3)反應(yīng)終止后純化上機


2、LC-MS/MS分析

(1)采用高分辨率液相色譜-串聯(lián)質(zhì)譜平臺(如Q Exactive系列)

(2)保證每個樣品獨立上機,避免交叉污染


3、數(shù)據(jù)處理

(1)使用MaxQuant或Proteome Discoverer等軟件提取肽段強度

(2)去除缺失值、標(biāo)準化處理

(3)統(tǒng)計顯著差異蛋白


三、無標(biāo)記定量技術(shù)的優(yōu)勢與局限

1、優(yōu)勢


無標(biāo)記定量技術(shù)(LFQ):原理、應(yīng)用與最


2、局限

(1)樣本間批次差異較大時,可能出現(xiàn)技術(shù)偏倚

(2)對質(zhì)譜設(shè)備穩(wěn)定性和操作一致性要求高

(3)缺失值處理對統(tǒng)計學(xué)方法依賴性強

百泰派克在LFQ服務(wù)中設(shè)置質(zhì)控樣 + 仿真調(diào)控樣本,顯著提升跨批次穩(wěn)定性與差異蛋白檢出率。


四、LFQ的經(jīng)典應(yīng)用場景

1、疾病機制研究

LFQ可揭示疾病組織與正常組織在dànbáizhì表達層面的差異,輔助構(gòu)建調(diào)控通路網(wǎng)絡(luò)。


2、藥物作用機制探索

通過比較藥物處理前后蛋白組變化,評估靶點表達及下游信號影響。


3、環(huán)境應(yīng)激與毒理響應(yīng)分析

用于研究細胞或微生物在高溫、重金屬、氧化應(yīng)激等條件下的蛋白響應(yīng)模式。


4、外泌體蛋白組定量

結(jié)合高靈敏度質(zhì)譜,LFQ成為外泌體功能蛋白譜構(gòu)建的重要工具。


五、zuì新進展:LFQ正在邁向更高精度與更強適應(yīng)性

1、DIA(Data-Independent Acquisition)+ LFQ

通過全掃描方式獲取MS/MS數(shù)據(jù),結(jié)合Spectronaut、DIA-NN等算法,實現(xiàn)更高數(shù)據(jù)完整性和定量一致性。


2、AI算法優(yōu)化定量流程

基于機器學(xué)習(xí)的缺失值補全、差異蛋白篩選、功能預(yù)測技術(shù)正在加速LFQ數(shù)據(jù)從“結(jié)果”到“發(fā)現(xiàn)”的轉(zhuǎn)化。


3、多組學(xué)聯(lián)合分析趨勢

LFQ蛋白組數(shù)據(jù)正越來越多與轉(zhuǎn)錄組、代謝組、磷酸化組等多組學(xué)數(shù)據(jù)融合使用,提升機制解析的系統(tǒng)性。


百泰派克生物科技:一站式無標(biāo)記定量蛋白服務(wù)平臺

作為生命科學(xué)CRO服務(wù)提供商,百泰派克生物科技深耕蛋白組學(xué)領(lǐng)域十余年,構(gòu)建了完善的LFQ服務(wù)體系,服務(wù)特色:


  • 高通量Orbitrap平臺,適配LFQ/DIA全策略

  • 提供蛋白提取、質(zhì)譜上機、數(shù)據(jù)分析一體化方案

  • 融合生物通路富集、PPI分析、GO/KEGG注釋等zhuānyè生信服務(wù) 可配套多組學(xué)聯(lián)合方案(如LFQ+轉(zhuǎn)錄組),推動科研從“變化”走向“機制”



無標(biāo)記定量技術(shù)作為一種兼具成本效率與研究深度的策略,已成為現(xiàn)代dànbáizhì組學(xué)中bùkěhuòquē的工具。未來,隨著儀器性能、算法水平與數(shù)據(jù)庫質(zhì)量的持續(xù)提升,LFQ將邁入更智能、更系統(tǒng)、更jīngzhǔn的時代。如果您正在開展蛋白表達、疾病機制、藥物篩選等相關(guān)研究,歡迎聯(lián)系我們獲取LFQ個性化服務(wù)方案!百泰派克生物科技助您高效獲取可靠數(shù)據(jù),推動成果落地!


百泰派克生物科技特色項目


一、蛋白測序

百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質(zhì)譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統(tǒng)對dànbáizhì序列進行分析,提供基于質(zhì)譜的蛋白測序分析服務(wù),包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析,Nduāncèxù,Cduāncèxù和全序列分析,以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務(wù)。對于未知理論序列的dànbáizhì,提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務(wù),對蛋白序列進行分析。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.采用目前世界上優(yōu)良的質(zhì)譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;

2.可實現(xiàn)對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;

3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;

4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;

5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug,即可完成檢測;

6.測序不受N端封閉,PEC和和糖基化等N端修飾的影響。



二、dànbáizhì組學(xué)

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質(zhì)譜平臺結(jié)合Nano-LC,提供定量dànbáizhì組學(xué)、靶向dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、翻譯后修飾蛋白組學(xué)等多種dànbáizhì組學(xué)分析服務(wù)。此外,百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學(xué)服務(wù),助力微量樣本蛋白組學(xué)、大樣本群醫(yī)學(xué)及高通量修飾組學(xué)等研究工作。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規(guī)模實驗分析,發(fā)現(xiàn)新的生物標(biāo)記物;

2.體內(nèi)體外多種dànbáizhì標(biāo)記方法,適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;

3.質(zhì)譜分析靈敏度高,實驗結(jié)果重復(fù)度高;

4.可檢測較低豐度蛋白,線性范圍廣;

5.zhuānyè生物信息學(xué)分析,分析更系統(tǒng)準確。



三、單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析

百泰派克生物科技采用Fluidigm質(zhì)譜流式系統(tǒng)進行單細胞質(zhì)譜流式技術(shù)分析,采用金屬元素標(biāo)記物(通常是金屬元素標(biāo)記的特異抗體)標(biāo)記細胞表面和內(nèi)部的分子,然后用流式細胞原理分離單個細胞,再用電感耦合等離子體質(zhì)譜(ICP-MS)分析單個細胞的原子質(zhì)量譜,zuì后將原子質(zhì)量譜數(shù)據(jù)轉(zhuǎn)換為細胞表面和內(nèi)部的信號分子表達量。


※服務(wù)優(yōu)勢:

1.技術(shù)優(yōu)良,*技術(shù)空白

采用金屬標(biāo)記抗體技術(shù),避免了傳統(tǒng)流式熒光通道少且易相互影響的問題??稍趩渭毎麑用嫔蠈Χ喾N指標(biāo)同時進行表征,百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標(biāo)蛋白。

2.分析數(shù)量大,成本較低

單細胞RNAseq受成本等因素限制,所有樣本細胞匯總的分析數(shù)目一般在2x10^4個左右,而流式質(zhì)譜技術(shù)一次(單樣本)就可分析至少10^5的細胞,實現(xiàn)了數(shù)量級的提高,且成本不高于單細胞RNAseq。

3.應(yīng)用前景大

①流式質(zhì)譜結(jié)果可以給出細胞亞群的變化,在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景;

②將金屬標(biāo)簽技術(shù)與其他技術(shù)結(jié)合會有新應(yīng)用方向。除常規(guī)蛋白外,質(zhì)譜流式細胞技術(shù)還可用于蛋白翻譯后修飾;

③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉(zhuǎn)錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。



四、基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)

百泰派克生物科技的基于高精度質(zhì)譜的免疫多肽組學(xué)分析及新抗原發(fā)現(xiàn)一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現(xiàn)10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優(yōu)化的高通量免疫多肽組學(xué)分析平臺進行免疫肽組學(xué)分析,可從zuì小的樣品材料中進行可重復(fù)的識別和定量。該服務(wù)可以應(yīng)用于大規(guī)模的研究,旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案,深入挖掘未知的靶標(biāo)。



五、生物藥物表征

百泰派克基于高分辨率質(zhì)譜技術(shù),MALDI TOF,高效色譜分離技術(shù),提供一系列完善的生物藥物分析方案,從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結(jié)構(gòu)分析,到產(chǎn)品變異性和純度分析。旨在提供優(yōu)質(zhì)生物藥物分析服務(wù),幫助生物醫(yī)藥生產(chǎn)商提高生物藥物品質(zhì)。



百泰派克生物科技七大檢測平臺

無標(biāo)記定量技術(shù)(LFQ):原理、應(yīng)用與最




百泰派克生物科技-生物制品表征,生物質(zhì)譜多組學(xué)優(yōu)質(zhì)服務(wù)商

北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫(yī)療器械行業(yè)提供質(zhì)量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務(wù)。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規(guī)和指導(dǎo)原則,通過CNAS/ISO9001雙重質(zhì)量體系認證,建立了完備的質(zhì)量體系,數(shù)據(jù)冷熱/異地備份,設(shè)備定期計量/期間核查,軟件審計追蹤,為客戶提供一體化解決方案和技術(shù)服務(wù),支持新藥研發(fā)、藥物申報注冊和生產(chǎn)放行。

1.公司采用ISO9001質(zhì)量控制體系,zhuānyè提供以質(zhì)譜為基礎(chǔ)的CRO檢測分析服務(wù);

2.獲國家CNAS實驗室認可,為客戶提供符合全球藥政法規(guī)的藥物質(zhì)量研究服務(wù);

3.業(yè)務(wù)范圍覆蓋dànbáizhì組學(xué)、多肽組學(xué)、代謝組學(xué)、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質(zhì)譜流式、生信云分析以及多組學(xué)生物質(zhì)譜整合分析等;

4.七大質(zhì)量控制檢測平臺,滿足您一站式服務(wù)需求;

5.服務(wù)3000+企業(yè),10000+客戶的選擇;

6.致力于為您提供優(yōu)質(zhì)的生物質(zhì)譜分析服務(wù)!



無標(biāo)記定量技術(shù)(LFQ):原理、應(yīng)用與最新進展檢測技術(shù)服務(wù)詳情介紹


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