Edman降解 vs 全長測序：從N端到C端的完整分析策略檢測技術服務詳情介紹
在dànbáizhì功能研究、重組蛋白驗證以及抗體藥開發過程中，一級結構的jīngquè確認（即氨基酸的線性序列）是zuì基礎也是zuì關鍵的一步。為實現這一目標，科研人員常用兩種技術路徑：
Edman降解：一種經典的化學方法，專注于N端氨基酸的逐個解析；
蛋白全長de novo測序：基于高分辨質譜與AI算法，可還原從N端到C端的完整蛋白序列。
這兩種技術各有優勢，也各有局限。那么在實際項目中，究竟該如何組合使用？是否存在一套更高效、更全面的N端+C端一體化結構分析策略？本文將從技術原理、適用場景、數據互補性及策略建議等方面，為您系統梳理 Edman 降解與全長測序的協同應用價值。
一、Edman降解：jīngzhǔn、可視的N端序列讀取方式
1、原理回顧
Edman降解通過苯異硫氰酸酯（PITC）選擇性標記蛋白的游離N端α-氨基酸，在每一輪循環中切除并鑒定一個殘基。該方法對氨基酸順序的“逐步確認”具有jígāo可信度。
2、技術優勢
（1）高精度：每一輪序列結果都基于化學反應確證；
（2）低背景：適用于單條帶、高純度蛋白；
（3）不依賴數據庫或質譜算法，結果直觀；
（4）對起始殘基的識別能力強，可判斷N端修飾/缺失/突變。
3、局限性
（1）jǐnxiànN端游離蛋白（若N端被修飾或封閉則無效）；
（2）無法識別蛋白內部結構；
（3）一般測序深度限制在10–15個氨基酸以內；
（4）需要蛋白純度高，且點樣量不少于5–10 pmol。
二、全長測序：從譜圖碎片還原蛋白全結構
1、原理簡述
蛋白全長測序采用多種蛋白酶（Trypsin、Glu-C、Asp-N 等）裂解目標蛋白，生成一系列重疊肽段；經高分辨質譜檢測后，通過AI拼接算法（如 PEAKS、pNovo、DeepNovo 等）直接從原始譜圖中還原蛋白的完整氨基酸序列，而無需參考數據庫。
2、技術優勢
（1）不依賴已知序列，適用于未知蛋白、突變體、人工構建體；
（2）可識別單點突變、異構體混合、剪接變體；
（3）同時解析N端、C端、內部結構與翻譯后修飾（PTMs）；
（4）起始量可低至1–10 ng，適用于低豐度樣本。
3、局限性
（1）N端解析依賴肽段生成情況，可能遺漏起始殘基；
（2）C端肽段較大或修飾多樣時，識別難度上升；
（3）結果依賴于譜圖質量與拼接算法；
（4）數據分析較為復雜，需人工復核與算法聯合判斷。
三、典型應用策略推薦
?? 場景一：重組抗體測序驗證
痛點：表達產品是否保留起始殘基？是否存在輕微突變？
推薦策略：Edman用于輕/重鏈N端jīngquè定位，全長測序確認V區結構與C端構建完整性
?? 場景二：融合蛋白功能區拼接確認
痛點：連接區是否完整表達？C端是否出現延伸或標簽缺失？
推薦策略：全長測序拼接全段結構，Edman確認起始殘基與剪切位置
?? 場景三：未知蛋白一級結構解析
痛點：數據庫無匹配、無核酸序列可供參考
推薦策略：全長測序主體結構解析 + Edman補強N端結果，實現數據庫獨立識別
四、百泰派克的一體化結構分析方案
百泰派克生物科技依托高分辨率質譜平臺（Orbitrap Eclipse、timsTOF Pro）與自動化Edman測序儀，提供如下服務組合：
Edman測序服務：支持PVDF膜直接上樣，zuì低檢測量1 pmol，序列深度可達15殘基；
蛋白全長測序服務：多酶裂解+AI算法拼接+人工復核，支持修飾識別、異構體分析；
一體化結構報告輸出：包括全序列圖、突變標注、修飾位點、端基確認信息，滿足生物藥注冊和IND申報需要。
我們致力于幫助科研和藥企從“看到序列”到“理解結構”，打通dànbáizhì從N端到C端的閉環表達驗證路徑。在dànbáizhì結構驗證的任務中，沒有一種技術可以“包打天下”，只有合理組合多種技術，才能獲得更高分辨率、更高可信度的結構全景。
百泰派克生物科技特色項目
一、蛋白測序
百泰派克生物科技使用Thermo公司新推出的Obitrap Fusion Lumos質譜儀及島津公司埃德曼降解測序系統對dànbáizhì序列進行分析，提供基于質譜的蛋白測序分析服務，包括對dànbáizhì的氨基酸組成分析，Nduāncèxù，Cduāncèxù和全序列分析，以及基于埃德曼降解的dànbáizhìN端序列分析服務。對于未知理論序列的dànbáizhì，提供基于從頭測序法的dànbáizhì從頭測序服務，對蛋白序列進行分析。
※服務優勢：
1.采用目前世界上優良的質譜儀器 Obitrap Fusion Lumos;
2.可實現對所測定靶蛋白序列 100% 的覆蓋;
3.可測定蛋白N端多達 70個氨基酸序列;
4.可測定多種形式的樣品: 蛋白溶液、PVDF 蛋白條帶;
5.樣品用量低: 蛋白樣品僅需 5-10ug，即可完成檢測;
6.測序不受N端封閉，PEC和和糖基化等N端修飾的影響。
二、dànbáizhì組學
百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos質譜平臺結合Nano-LC，提供定量dànbáizhì組學、靶向dànbáizhì組學、多肽組學、翻譯后修飾蛋白組學等多種dànbáizhì組學分析服務。此外，百泰派克生物科技新推出基于timsTOF Pro的4Ddànbáizhì組學服務，助力微量樣本蛋白組學、大樣本群醫學及高通量修飾組學等研究工作。
※服務優勢：
1 .高通量定量蛋白分析:多對照組大規模實驗分析，發現新的生物標記物;
2.體內體外多種dànbáizhì標記方法，適用于分析組織、細胞、血液等多種樣品;
3.質譜分析靈敏度高，實驗結果重復度高;
4.可檢測較低豐度蛋白，線性范圍廣;
5.zhuānyè生物信息學分析，分析更系統準確。
三、單細胞質譜流式技術分析
百泰派克生物科技采用Fluidigm質譜流式系統進行單細胞質譜流式技術分析，采用金屬元素標記物（通常是金屬元素標記的特異抗體）標記細胞表面和內部的分子，然后用流式細胞原理分離單個細胞，再用電感耦合等離子體質譜（ICP-MS）分析單個細胞的原子質量譜，zuì后將原子質量譜數據轉換為細胞表面和內部的信號分子表達量。
※服務優勢：
1.技術優良，*技術空白
采用金屬標記抗體技術，避免了傳統流式熒光通道少且易相互影響的問題。可在單細胞層面上對多種指標同時進行表征，百泰派克生物科技可做到同時檢測51個目標蛋白。
2.分析數量大，成本較低
單細胞RNAseq受成本等因素限制，所有樣本細胞匯總的分析數目一般在2x10^4個左右，而流式質譜技術一次（單樣本）就可分析至少10^5的細胞，實現了數量級的提高，且成本不高于單細胞RNAseq。
3.應用前景大
①流式質譜結果可以給出細胞亞群的變化，在臨床診斷、疾病機制研究等方面具有極大的研究前景；
②將金屬標簽技術與其他技術結合會有新應用方向。除常規蛋白外，質譜流式細胞技術還可用于蛋白翻譯后修飾；
③可檢測細胞存活率、細胞大小、mRNA轉錄子表達量、DNA合成速率以及蛋白酶活性等。
四、基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現
百泰派克生物科技的基于高精度質譜的免疫多肽組學分析及新抗原發現一站式解決方案包括我們專有的、高度敏感的免疫肽富集和鑒定方案。我們能夠幫助您實現10,000個以上I型多肽和10,000個以上II型多肽的鑒定和識別。通過我們優化的高通量免疫多肽組學分析平臺進行免疫肽組學分析，可從zuì小的樣品材料中進行可重復的識別和定量。該服務可以應用于大規模的研究，旨在助力科研工作者尋找癌癥、免疫疾病及傳染病的解決方案，深入挖掘未知的靶標。
五、生物藥物表征
百泰派克基于高分辨率質譜技術，MALDI TOF，高效色譜分離技術，提供一系列完善的生物藥物分析方案，從dànbáizhì、多肽、抗體、疫苗等生物制品的氨基酸組成和一級結構分析，到產品變異性和純度分析。旨在提供優質生物藥物分析服務，幫助生物醫藥生產商提高生物藥物品質。
百泰派克生物科技七大檢測平臺
百泰派克生物科技-生物制品表征，生物質譜多組學優質服務商
北京百泰派克生物科技有限公司致力于為生物/制藥和醫療器械行業提供質量控制檢測和項目驗證等zhuānyè服務。公司實驗室遵循NMPA、ICH、FDA和EMA等的法規和指導原則，通過CNAS/ISO9001雙重質量體系認證，建立了完備的質量體系，數據冷熱/異地備份，設備定期計量/期間核查，軟件審計追蹤，為客戶提供一體化解決方案和技術服務，支持新藥研發、藥物申報注冊和生產放行。
1.公司采用ISO9001質量控制體系，zhuānyè提供以質譜為基礎的CRO檢測分析服務；
2.獲國家CNAS實驗室認可，為客戶提供符合全球藥政法規的藥物質量研究服務；
3.業務范圍覆蓋dànbáizhì組學、多肽組學、代謝組學、生物藥物表征、單細胞分析、單細胞質譜流式、生信云分析以及多組學生物質譜整合分析等；
4.七大質量控制檢測平臺，滿足您一站式服務需求；
5.服務3000+企業，10000+客戶的選擇；
6.致力于為您提供優質的生物質譜分析服務!
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