XRM技術在生命科學領域中有著非常廣泛的應用，高分辨斷層三維掃描主要可以應用于骨科學、口腔科學、植物學以及醫學領域中的呼吸系統研究、血管系統研究以及生物制藥研究等方面。這其中，骨科學是早引入XRM技術的，且目前的應用情況為成熟。
實例
大鼠骨小梁局部壁厚分布三維表征，Bruker Skyscan1276
骨活檢，機械載荷，Bruker Skyscan1275
羊骨，鈦植入物三維形貌表征，Bruker Skyscan 1275
小鼠脛骨壁厚分布三維體渲染圖，Bruker Skyscan 1272
雌性石蜂三維體渲染圖，（a）背部；（b）腹部 Bruker Skyscan 1272
尼安德特人頭骨三維體渲染圖，Bruker Skyscan1273
牙本質小管多尺度三維分析，Bruker Skyscan 2214
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