氨基酸分析儀，是指用于測定蛋白質、肽及其他藥物制劑的氨基酸組成或含量的方法。進行氨基酸分析前，必須將蛋白質及肽水解成單個氨基酸。它是基于陽離子交換柱分離、柱后茚三酮衍生、光度法測定的離子交換色譜儀。氨基酸分析儀由色譜柱、自動進樣器、檢測器、數據記錄和處理系統組成。氨基酸分析儀的基本原理為流動相（緩沖溶液）推動氨基酸混合物流經裝有陽離子交換樹脂的色譜柱，各氨基酸與樹脂中的交換基團進行離子交換，當用不同的pH緩沖溶液進行洗脫時因交換能力的不同而將氨基酸混合物分離，分離出的單個氨基酸組分與茚三酮試劑反應，生成紫色化合物或黃色化合物，用可見光檢測器檢測其在570nm、440rnn的吸光度。這些有色產物對應的吸收強度與洗脫出來的各氨基酸濃度之間的關系符合朗伯-比爾定律。據此，可對氨基酸各組分進行定性、定量分析。氨基酸分析儀也可利用陰離子交換分離后經積分脈沖安培法檢測，該檢測方法無需將待測氨基酸進行柱前或柱后衍生。