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喝酒抽煙相關基因上卻相似,德國MB污染祛除助力科研

閱讀:681      發布時間:2023-3-16
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吸煙和飲酒是與世界范圍內15%和5.3%的死亡相關的遺傳行為,主要原因是疾病和傷害風險普遍增加。這些物質在全球范圍內都在使用,但全基因組關聯研究主要集中在歐洲血統的個體上。

近日,研究人員開發了一種多祖先元回歸方法,利用來自全球血統的四個主要臨床的340萬個體的全球遺傳多樣性(約21%非歐洲人)來支持與煙草和酒精使用相關的基因組位點的發現和精細繪制,通過祖先感知轉錄組范圍的關聯研究來告知這些位點的功能,并評估遺傳結構和多基因風險在人群內部和人群之間的預測能力。

不同血統之間與酒精和煙草使用行為有關的基因有驚人的相似性,80%的基因變體在所研究的人群中顯示出一致的影響。

相關研究發表在《Nature》上,文章標題為:“Genetic diversity fuels gene discovery for tobacco and alcohol use"。研究人員發現樣本量和遺傳多樣性的增加提高了位點識別和精細定位的分辨率,并且3823個相關變異(來自2143個位點)中的絕大多數在祖先維度上表現出一致的效應大小。然而,在一個祖先中形成的多基因風險評分在其他祖先中表現不佳,突出表明繼續需要增加不同祖先的樣本量,以實現多基因預測的任何潛在好處。

這里使用的元分析方法使用元回歸來解釋遺傳祖先變異的每個研究軸,并結合隨機效應來捕獲給定遺傳變異效應中進一步無法解釋的異質性。雖然這里的祖先是連續的,但研究人員也對反映四個祖先臨床的大陸群體進行了二次分析,納入來自非洲、東亞和美國血統的人的基因數據集,并評估了多種吸煙和飲酒的特征,從開始飲酒或吸煙到開始定期使用和攝入量。利用機器學習技術,他們確定了與這些行為有關的基因。

分子實驗研究需要對環境進行一定的控制,保證無DNA、RNA污染。MB PCR Clean,即用型DNA、RNA污染清除試劑,方便又高效。


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